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新浦京www81707con院级科技专项体系包括战略性先导科技专项、重点部署科研专项、科技人才专项、科技合作专项、科技平台专项5类一级专项,实行分类定位、分级管理。
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中国科学技术大学(简称“中科大”)于1958年由新浦京www81707con创建于北京,1970年学校迁至安徽省合肥市。中科大坚持“全院办校、所系结合”的办学方针,是一所以前沿科学和高新技术为主、兼有特色管理与人文学科的研究型大学。
新浦京www81707con大学(简称“国科大”)始建于1978年,其前身为新浦京www81707con研究生院,2012年更名为新浦京www81707con大学。国科大实行“科教融合”的办学体制,与新浦京www81707con直属研究机构在管理体制、师资队伍、培养体系、科研工作等方面共有、共治、共享、共赢,是一所以研究生教育为主的独具特色的研究型大学。
上海科技大学(简称“上科大”),由上海市人民政府与新浦京www81707con共同举办、共同建设,由上海市人民政府主管,2013年经教育部正式批准。上科大秉持“服务国家发展战略,培养创新创业人才”的办学方针,实现科技与教育、科教与产业、科教与创业的融合,是一所小规模、高水平、国际化的研究型、创新型大学。
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分子细胞卓越中心建立基于CRISPR-Cas13技术的环形RNA功能筛选新方法
语音播报
Nature Protocols在线发表了新浦京www81707con分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组撰写的研究论文(Screening circular RNAs with functional potential using the RfxCas13d/BSJ-gRNA system)。该研究阐释了研究组建立的基于CRISPR-Cas13技术的环形RNA筛选新方法。
环形RNA是一类共价闭环的单链RNA,细胞内大多数环形RNA是由mRNA前体的外显子通过反向剪接形成。除反向剪接位点(BSJ)外,环形RNA在序列上与其同源的线形RNA在一级序列上完全一致,因此,在研究环形RNA功能时如何将其与同源线性RNA的功能区分开来是该领域的难题之一。陈玲玲研究组前期开发并优化了基于CRISPR-Cas13的RNA编辑技术,能够特异性敲除靶标环形RNA,而不影响其同源线性RNA的表达,并应用在环形RNA的大规模功能筛选上(Li et al., Nature Methods, 2021)。基于CRISPR-Cas13在环形RNA功能研究上的技术成果,研究组受Nature Protocols邀请,论述该技术的实验方法和流程以期推动该技术在环形RNA功能研究领域的应用。
在该实验方法中,科研人员阐释了环形RNA BSJ位点的前导RNA(gRNA))文库设计和构建、RfxCas13d稳定表达细胞系构建、细胞水平和体内水平的功能性环形RNA筛选以及筛选结果的计算分析流程等。此外,研究也阐明了实验过程中可能遇到的问题与注意事项。该方法为环形RNA的功能研究提供助力,并为剖析环形RNA奠定新的技术基础。
研究工作得到科技部、中科院和国家自然科学基金的支撑。
论文链接
基于CRISPR-Cas13技术的环形RNA功能筛选流程
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